马口水文站位于西、北江三角洲河网区的顶端，是西江进人河网区前必经的第一关隘,是国家重点监测站。掌握和预报马口水文站的水情是做好其下游防洪抗洪工作的关键。马口水文站防洪警戒水位为7．50m，1951～1998年实测最高水位为1994年6月20日达到的10．06m。
广东省马口水文站应用的水质自动监测系统（WQMS）是一套以在线自动分析仪、可编程控制器PLC为核心，运用现代传感器技术、自动测量技术、自动控制技术、计算机应用技术以及相关的专用分析软件和通信网络所组成的综合性监测系统。该系统可以实现水质的实时连续监测和远程控制，达到及时掌握主要流域重点断面水体的水质状况、预警预报重大或流域性水质污染事故、解决跨行政区域的水污染事故纠纷、监测总量控制制度落实情况。
建立了水质自动监测系统，监测参数包括：pH、温度、电导、氨氮、溶解氧、生化耗氧量、化学耗氧量、总有机碳、总氮、总磷等。该系统依托GSM无线网络，基于GPRS技术应用HY水质监测管理系统软件（HY—WQMS）实时获得最新数据以及运行状态，当监测数据超过报警门限或仪器发生故障时，系统自动向用户发送报警信息。监测子站各水质分析仪通过RS-485总线和通讯控制单元RTU相连，实现系统集成。
走航式声学多普勒流速剖面仪ADCP进行流速进行流速测量，不过现在已经改用自动横向发送声波的方式来测流速，也就是声纳系统，先通过多组实测流速率定出参数，然后就只用测西江的一半河流就能求出西江整个断面的流速
