1978年,魏泰克和马古来斯,据分子生物学研究的最新资料,提出一个新的三原界学说。他们认为生物进化的早期,各类生物都是由一类共同的祖先沿着三条进化路线发展,形成了三个原界:古细菌原界,包括产甲烷菌、极端嗜盐菌、嗜热嗜酸菌;真细菌原界,包括蓝细菌和各种原核生物(除古细菌外);真核生物原界,包括原生生物、真菌、动物、植物。三原界系统还吸收了真核起源的“内共生学说”的思想。三原界系统目前正受到人们的重视。
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