除了VPN的身份验证采用PPP的身份验证方法，下面介绍一下VPN进行身份验证的几种方法。
CHAP：CHAP通过使用MD5（一种工业标准的散列方案）来协商一种加密身份验证的安全形式。CHAP在响应时使用质询-响应机制和单向MD5散列。用这种方法，可以向服务器证明客户机知道密码，但不必实际地将密码发送到网络上。
MS-CHAP：同CHAP相似，微软开发MS-CHAP是为了对远程Windows工作站进行身份验证，它在响应时使用质询-响应机制和单向加密。而且MS-CHAP不要求使用原文或可逆加密密码。
MS-CHAP v2：MS-CHAP v2是微软开发的第二版的质询握手身份验证协议，它提供了相互身份验证和更强大的初始数据密钥，而且发送和接收分别使用不同的密钥。如果将VPN连接配置为用MS-CHAP v2作为唯一的身份验证方法，那么客户端和服务器端都要证明其身份，如果所连接的服务器不提供对自己身份的验证，则连接将被断开。
EAP：EAP的开发是为了适应对使用其他安全设备的远程访问用户进行身份验证的日益增长的需求。通过使用EAP，可以增加对许多身份验证方案的支持，其中包括令牌卡、一次性密码、使用智能卡的公钥身份验证、证书及其他身份验证。对于VPN来说，使用EAP可以防止暴力或词典攻击及密码猜测，提供比其他身份验证方法（例如CHAP）更高的安全性。
在Windows系统中，对于采用智能卡进行身份验证，将采用EAP验证方法；对于通过密码进行身份验证，将采用CHAP、MS-CHAP或MS-CHAP v2验证方法。