甲醛有强烈的刺激性，浓度较低时，使人的眼睛有辣感，流泪，红肿。浓度稍高时，就会感到呛，恶心甚至呼吸困难、窒息。这些“生化反应”，来自于甲醛的毒性。甲醛是最小的含氧有机物，具有较高的反应活性，可以和带有—OH（羟基）、—SH（巯基）、—NH2（氨基）基团的分子发生亲核加成反应，最终甲醛作为亚甲基（—CH2—）的提供者，与上述基团中的两个基团反应，使自由的分子链被甲醛交联起来，失去原有的生理功能。这就好比我们的双手，每只手代表一个上述的基团，如同甲醛的一副手铐铐住了原本自由的双手（哪怕是铐住一只），就使我们的手失去了原有的自由功能。人体的细胞内、酶系统存在着大量的羟基、巯基、氨基，接触甲醛后会立即发生反应，产生细胞毒性，使蛋白质变性（甲醛超强的杀菌能力正是原自这种反应）。从这种“生化反应”的即时结果看，是人感到不适；从长远看，不能排除甲醛具有潜在的致癌性。
甲醛的释放期长达8～15年，就靠开窗通风解决不了问题。根据研究：人造板材中的甲醛完全释放通常需要8～15年的时间，相比之下，只几个月的通风是不能从根本上解决问题的。
长期接触低剂量甲醛可引起慢性呼吸道疾病，引起鼻咽癌、结肠癌、脑瘤、月经紊乱、细胞核的基因突变，DNA单链内交链和DNA与蛋白质交链及抑制DNA损伤的修复；引起妊娠综合征、新生儿染色体异常、白血病；引起青少年记忆力和智力下降。在接触的人群中，儿童和孕妇对甲醛尤为敏感，危害也更大。
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