传染病预防控制所是中国疾病预防控制中心领导下的国家级传染病预防控制专业机构,是全国传染病预防控制业务技术指导中心。长期以来,传染病所缺少一套可用于高性能计算的集群系统,使其在基因分析等业务运行方面受到较大限制;与同行业的院所相比有一定差距。
因此传染病所决定构建一套生物信息计算集群,为其下属各实验室提供一个统一计算平台,提高计算机应用和管理水平。
用户需求:
传染病预防控制所需要该集群系统能够承担大规模运算任务,包括序列的多重比对、系统发育学研究、细菌全基因组序列分析、生物信息学综合分析等。
方案描述:
宝德科技根据客户要求,推荐基于四核至强服务器的POWER Cluster8000 HPC系统解决方案,宝德POWER Cluster8000 HPC系统分层次设计,按照高性能计算生态系统部署,自上而下,包括HPC并行应用程序、中间件集群管理、通信库以及各类软件优化工具、操作系统、计算节点和主控节点的硬件平台、互联网络系统等。方案具有开放性、可扩展、性价比高的特点,满足传染病所的的应用需求。
依照初步草案,宝德科技与华大基因、照生软件与客户进行了多次交流,向客户详细介绍了方案中的种种优点,突出了宝德产品的优势,获得了客户的赞同。在这个过程中,华大基因项目的成功有很大帮助,因为有华大基因项目的经验,流行病所对宝德科技的能力表示认可。
其中管理节点服务器采用宝德PR2700服务器,存储节点采用PR3015S,计算节点采用宝德PR1760T高密度计算服务器。
技术亮点:
宝德IA服务器具有以下几个鲜明的特点:
可伸缩性(Scalability),当服务的负载增长时,系统可被扩展来满足需求,且不降低服务质量。
高可用性(Availability),尽管部分硬件和软件会发生故障,整个系统的服务必须是每天24小时每星期7天可用的。
可管理性(Manageability),整个系统可能在物理上很大,但应该容易管理。
价格合理(Cost-effectiveness),整个系统实现是经济的、易支付的。
系统拓扑图: