据台湾媒体报道，台国防部今日上午表示，护渔工作依法主要由海巡署或农委会协同负责，并可视需要协调海军支持，上周台、日发生渔事纠纷时，海巡署并未向海军提出支持需求，对于亲民党立委林郁芳要求军方本周五出动济阳级巡防舰进行护渔考察，国防部说，无多余兵力，目前没有派遣计划。
据悉，海军总部战训署署长李皓称，依海岸巡防法、渔业法等相关规定，有关渔业巡护为海巡署及农委会权责。海军在海上的任务兵力，也都负有应援护渔的责任，但依法须由海巡署提出申请，九号纠纷发生时，为日本水产厅公船阻碍台湾渔民渔业活动，海巡署舰船进行护渔，并未要求支持。
据了解，对于立委林郁芳要求海军出动军舰进行护渔视察，国防部称，正值汉光演习兵力调派高峰，目前没有多余兵力，海军不是不护渔，而是本着不引发争端，不升高冲突，兼顾渔民生计，全力协助海巡署，共同执行护渔。据凤凰卫视六月十五日消息：据台湾媒体报道，台立法院“国防委员会”发函要求考察海军护渔任务，军方出尔反尔，“国防部”作战次长程士瑜上午举行记者会说，海军虽然没有多余舰艇可以调派，但是最近引起争端的海域，会有例行的东北侦任务舰在附近巡弋。据了解，“国防部”不愿派军舰护渔，是因为“行政院”没有政策指示，“国安会”也要求军方克制。
据指出，“国防部长”李杰不愿加派军舰护渔，主要是因为“行政院”没有政策指示，军方不能跑在政府的政策前面，加上“国安会”主张低调处理，不能擦枪走火，与日方冲突升高，军方内部面对立委与民众的质疑，是心中有苦说不出。
据了解，李登辉时期，军方对护渔任务十分重视，与现在全推给海巡署，不可同日而语，“国防部”曾在1989年与1990年间，草拟完成极机密护渔计画，当时还向李登辉提出演示文稿，这项计画的对象包括当时日渐增多的大陆渔船越界以及日本舰艇骚扰台方渔船。
海军战训署署长李皓说，最近宜兰外海发生渔事纠纷，当天附近有两艘济阳级舰与海巡署六艘舰艇，都完成无线电构连，距离发生争议的海域有25浬，如果事态扩大，可在1小时内赶往。另外在基隆港内还有三艘锦江级舰备援，这些都有案可查。依法海军必须等候海巡署提出需求才会前往护渔，但海军舰艇过去曾超越钓鱼台30浬的海域进行过人道救援，不是只在24浬内的范围活动。
李皓表示，海军的辅战舰艇才在24浬内，24浬到60浬则是主战舰艇，舰艇的出动完全看任务特性而定。他说，最近引起争议的海域，每天都有300艘舰艇进出，军方都要派飞机与舰艇前往识别，逐一辨识，但是渔民被日本舰艇骚扰时，只向渔会与海巡署报告，没有告诉军方，海巡署认为自己可以处理，就不会找军方援助。
