小智一行人终于来到枯叶市。首先到神奇宝贝中心填饱肚子，在那里，小智等人目击了好几只身受重伤的神奇宝贝。原来他们是向枯叶市道馆的训练家挑战而被打伤的。皮卡丘对付进化型的雷丘，看似完全没有胜算。小智他们会成功拿到第三个徽章吗?
第15集--圣安奴号之战
小智等人来到停泊国外船只的港口。在那里得到神奇宝贝训练家派对的招待券，他们不知这是火箭队的阴谋，傻傻上船了，还在那里与人交换神奇宝贝．．．．
第16集--神奇宝贝漂流记
小智等人在船上受到火箭队攻击。就在一片混战中，船不知不觉漂到湾外，还遇到暴风雨。船员与乘客们都搭救生艇逃脱了，只有小智等人与火箭队昏迷在船上。眼看船只渐渐沉没，神奇宝贝逃亡剧开始了．．．．
第17集--巨大神奇宝贝之岛
小智等人与火箭队被暴鲤龙的龙之怒给吹跑，还与自己的神奇宝贝们分散。他们在岛上互相寻找对方。这座岛有许多巨大无比的神奇宝贝，这里到底是哪里呢？
第18集--蓝普尔其的假日(电视剧剧网 http://juqing.)
渡假村蓝普尔其，柳爷爷的梦想是乘着一艘船游览世界一周，于是小智等人便帮忙柳爷爷工作。但是火箭队和附近的金婆婆想尽办法破坏。最后火箭队等人又被打飞出去了。而柳爷爷也开始了他的梦想。
第19集--玛瑙水母与毒刺水母
小智等人来到一个码头都市，在那里遇见与金婆婆长相一模一样的银婆婆。她矢志要让这小地方成为超越蓝普尔其的渡假地，在海上大兴土木，而引来玛瑙水母和毒刺水母的反击。
第20集--幽灵神奇宝贝跟夏天的庙会
小智等人来到一个港都，那里正在举办夏天庙会。小刚一到那里就感受到少女的呼唤。火箭队的小次郎也是同样经验。两人为了少女而失魂落魄，原来那少女是两千年前的亡魂。神奇宝贝鬼斯与她陪伴，搞得大伙吓得魂都飞了。
第21集--巴大蝴再见
小智等人来到海边，遇到一群渡海的巴大蝴。巴大蝴正迎接恋爱的季节，连小智的巴大蝴也找到可爱的女朋友高兴得要命。但是火箭队的人居然又出现了，想捉走巴大蝴去卖，巴大蝴去英雄救美吧。
第22集--卡西，超能力大决斗
金黄市的道馆训练家是娜姿，她的神奇宝贝卡西会用超能力，把皮卡丘耍得团团转。惨败的小智等人还差点被变成娃娃囚禁起来，幸亏被一个老人救起，那个人指点小智获胜的方法。
第23集--在神奇宝贝塔收服幽灵
为了打败娜姿的超能力神奇宝贝，小智按照老人指示来到耸立在雾中的神奇宝贝塔，想收服这里的幽灵神奇宝贝。最后虽然没收服成功，但是离开时有只鬼斯通自愿跟上来，也算是小有收获吧。
第24集--鬼斯通对抗超能力
小智有了鬼斯通跟踪，又壮起胆子去向娜姿挑战。可是临阵时鬼斯通又不见影，跟在一旁的小刚与小霞成了代替小智受罚的倒霉鬼，被变成娃娃，小智忍无可忍，再度挑战．．．
第25集--火爆猴别生气哦
小智遇见猴怪想加以收服，反而遭受攻击。此时火箭队过来搅局，踹了猴怪一腿，使得猴怪气愤进化成火爆猴，不管小智怎么逃，火爆猴都一再追上来，最后小智只好向火爆猴挑战。
