无论如何，大家总算是平安到了月球。
选项：1，那个星球是……?2，这里是?
莎莉莎：要是早点去帮卡伊的话……
选项：1，那也不行的。2，要是那样就好了。
正在大家互相安慰的时候，雷瓦带着一队人包围了这里，周围没有一条可以逃跑的路。
选项：1，投降。2，战斗。
绝对不能在这里就投降，那样对不起卡伊的生命!大家决心上去与敌人拼命的时候，奇迹出现了，一个叫阿娜(アナ)的新人类带着大家逃到了地下秘密基地。她介绍自己，说是一个名叫レジスタンス的组织的领袖。她看到过一本200年前的日记，原来大家知道的事情之外还有很多之前并未听闻过的秘密——所谓的“月球女神”其实也是一个拥有高度智能的机器，新人类也其实只是改变了人类DNA而生成的种族。200年前的战争，是人类、新人类和机器人联合起来与“女神”战争。
这一次就让三个种族再次联合起来与女神战斗吧!不过要想打败“女神”，必须先毁掉她的光量子能量之源(フォトンエネルギー)。阿娜说有一个坏掉的机器人身体，里面可能有关于这个能量之源的记忆，并自荐来为大家引路。
选项：1，拒绝。2，接受。
阿娜是领袖，还有更重要的事情等着她去处理，大家决定自己去。阿娜给大家了一个无线电装置，可以随时保持联系。出发!
アルカプラント
一路深入，来到“女神”堆积200年前机器人“尸体”的地方，欧基找到了自己的身体。新的身体不仅更好看，里面还有关于200年前战争的所有资料。大家继续深入，寻找并破坏光量子能量之源。
刚刚找到能量之源，“女神”就让雷瓦来阻止。莎莉莎劝雷瓦，欧基也将整理好的记忆说出作为证据，可是雷瓦只是迟疑了一下，最后还是听从了“女神”的命令。雷瓦还是驾驶上一回的两个飞机，不过两个飞机组合成了机器人。战胜后，“女神”抛弃了连续失败两次的雷瓦，尽管莎莉莎努力挽留，他还是走了。后会有期……
(アルカプラント任务结束)
大家回到指挥部，阿娜看到所有人安全归来，才松了一口气。欧基说新身体中的记忆和阿娜所说的一样，“女神”原本只是一个人造的智能计算机，突然有一天不知道什么原因变得狂暴起来。人类当然要反抗，于是人类、新人类、机器人三个种族联手，把“女神”逼到月球上，可是“女神”并不死心，用光量子射线将地球毁灭……
大家正说着话，雷瓦突然出现了!阿娜以为又是“女神”派来的。
选项：1，他和我们是一伙的!2，他不是敌人!3，你怎么来这了!
雷瓦说确实已经没有再和我们继续争斗的理由了，因为所有的新人类都被“女神”舍弃了。他这次来是要提醒大家，现在既不知道能量之源的位置，也没有消灭它的能力，这样下去只会让地球再一次遭到毁灭性的打击!
选项：1，没关系，因为我们还有朋友。2，要是真这样的话……
雷瓦拒绝了大家的邀请，只是能量之源和守卫机器人的配置图拿出来。
选项：1，雷瓦永远是我们的朋友。2，一起战斗吧!3，一定要小心啊!
雷瓦经不住大家盛意相邀，终于决定加入。安娜也决定舍弃这个指挥部，尽全力支持大家与“女神”决战!
选项：1，默默点头。2，大声应和!
暗黒神殿
一路深入神殿内部，突然，无线电发出异样的声音，可能信号又要中断了吧。中断前进行与阿娜的最后一次对话，她说马上就要进入能量中心所在的区域了，那里会有守卫机器。阿娜莫名突然特别担心大家。
选项：1，我们会活着回去的。2，就等着我们的好消息吧!3，相信我们的实力吧。
继续前进，进入到一个乳白色的神殿。大家走了半天还没到头，不免感叹这里不愧是“女神”住的地方，还真挺复杂的。莎莉莎担心已经暴露了指挥部位置的阿娜，用无线电连接过去，听到那边似乎出了很大的问题。
选项：1，相信阿娜能处理好的。2，去帮阿娜。3，放弃吧。
既然已经到了这里，阿娜那边也还在战斗，所以相信她吧!大家也继续努力!
终于跑出乳白色的神殿，见到了传说中的“女神”玛泽特丽尼缇。
选项：1，没什么大不了的。2，稍微有点辛苦啊。3，真不容易。4，这迷宫走得我都想死了。
莎莉莎说只想问“女神”一个问题——既然是被人类所制造出来、为人类造福的，为什么后来会想要毁灭人类呢?“女神”说莎莉莎搞错了，她是为了改善地球环境而存在的，人类怎样和她并没有关系。为了防止恢复势力后的人类和机器人来找事，100年前“女神”制作出了新人类，所以新人类在女神眼中只不过是送死鬼罢了。听到这里，大家都气愤难耐，可正要冲上去捣毁“女神”老巢的时候，被突然从天上降下来光量子射线击倒……
选项：1，不放弃，站起来继续战斗!2，默默站起来战斗。
“女神”继续放大话，说大家很快就会明白这一切都是白费力气的。
选项：1，怎么可能是白费力气!2，怒视“女神”。
