在此次医改国八条中，最引人注目的是关于公立医院改革的阐述。意见指出，要稳步推进公立医院改革试点,调整公立医院布局和结构,改革公立医院补偿机制,探索管办分开的有效形式。
众所周知，公立医院在卫生事业中起着龙头作用，如果公立医院不改革，医改就难以成功。然而，由于涉及众多环节和利益纠葛，公立医院的改革方式与方法迟迟难以出台，即使在新医改方案中，对于这个环节的改革方向仍然有语焉不详之处。
正因为如此，在此次国八条中，明确了改革的方向，但也给具体的操作方式留下了些许疑问。
试点推进要“稳”字当头
专业人士认为，此次“国八条”再次强调了确保公立医院的公益性，同时也明确指出要稳步推进公立医院的试点规模。
全国政协委员、中日友好医院主任医师、教授安阿玥认为，公立医院要坚持医疗卫生服务的公益性,把患者的利益和社会效益放在首位, “以病人为中心”。这是保证医改成功的关键之一。
值得注意的是，此次国八条中明确要求稳步推进试点，这就将人们先前所认为的“大量医院公营变私营”的理解不甚相同。专业人士指出，作为新医改最艰难的一环，公立医院改革将先试点积累经验然后推行，不会一蹴而就。
与公立医院试点相配套的是公共财政对试点医院的补助，倘若一下子扩大试点比例，则会使财政补助的实施发生错乱。医改专家李玲此前在媒体发表的观点指出，目前公共财政的定位尚未明确，因而公立医院的规模、资源布局和职能如何确定，政府对公立医院补贴的规模、方式如何确定，医保和卫生的行政管理体制如何理顺等重大的问题也没有明确，这需要更进一步的试点、探索。
补偿机制改革如何进行
相对于前两点，专业人士的争论焦点仍然集中在补偿机制和管办分开。
在4月份公布的新医改方案中提出，试点改革的公立医院将取消15%的药品加成，并通过政府合理补偿，增设药事服务费并将费用纳入医保等途径，保障公立医院回归公益性，即补偿机制的核心在于“政府购买服务”。
实际上，公立医院要改变以药补医方式、完善补偿机制等提法已经说了很多年，但应该如何操作却一直没有明确的指导方针。
全国政协委员、南京医科大学教授、博士生导师孙南雄此前在接受中国证券报采访中指出，国家应承担公立医院医务人员的部分工资补贴和政府统一采购的基本医疗用药费用，负责协调地区间的财政能力差异问题，设置专项税收用于公民基本医疗保障；地方政府承担医务人员部分工资、福利待遇和公立医疗机构的基本建设与医疗设备配置等费用。
另一个争论焦点是所谓管办分开，即从强化公立医院公益性和政府有效监管出发，积极探索政事分开、管办分开的多种实现形式。然而这一点在当前操作上难度也不小。北京电力医院院长林方才此前对中国证券报记者表示，鼓励各地积极探索政事分开、管办分开的有效形式还是比较原则性的东西，具体操作该如何做的问题还没有完全解决。
