，正要启航时，美国联邦调查局特工突然上船搜查。钱学森被说成是间谍被关到特米那岛上，800多公斤的书籍和笔记本被扣下来。赵忠尧也受到了盘查，几十箱东西全被打开。幸好他早在一个月前就已将重要资料和器材托人带回中国了，其余的零部件又拆散了随意装箱，也查不出什么来。
船放行后，在海上颠簸数日，眼看就要到达祖国了，但谁也没想到，船经日本横滨时，他同另外两名中国学者沈善炯和罗时均突然遭到了驻日美军的扣留。他们被送到下野巢鸭监狱，远东最大的一个监狱。赵忠尧和沈善炯、罗时均被关起来后，起初也不审问，每天早晨只给他们指定一个地方，可以出来走走，三个人也可以谈话。平时下午也有放风的时间，三个人就在这些时间里考虑对策。
这期间，台湾的国民党派人来看他们，赵忠尧他们都是蒋介石的政府出钱派出去的，自然不希望他们落到共产党手里。国民党提出，一个是回美国，一个是回台湾，让三人选择。赵忠尧表示，我们回去只是教教书，别的没什么。台湾大学校长傅斯年也来了电报，聘三人为台湾大学教授，让他们考虑，被赵忠尧他们拒绝了。
赵忠尧在日本被美军扣押的消息，没多久就传回了国内。周总理代表政务院和外交部发表声明，抗议美帝无理扣押中国科学家回国。吴有训代表198位科学家发表声明，各界舆论都抗议美国这样做。世界舆论一派哗然，美国国内科学家也纷纷提起质疑和抗议。美军最高司令部实在找不到什么理由，在赵忠尧他们被扣押58天之后不得不放行。赵忠尧回到国内不久，便和那些十分珍贵的器材一起，落户到了北京的近代物理研究所。
约里奥·居里夫人一看到他进去，就笑了。
1948年6月，物理学家钱三强离开巴黎，回到北平。不久，南京方面便派人来找他，要他赶紧离开北平，准备一起撤退。钱三强以母亲需要照顾为由没有答应，而走了一条另外的道路。
1949年3月，他由中共组织安排，参加由郭沫若率领的代表团去巴黎出席世界人民保卫和平大会。他想到这次是个机会，可以通过居里实验室的约里奥·居里先生及其夫人帮助购买一些仪器和图书。然而，由于法国不给中国代表团去巴黎的签证，钱三强没有去成巴黎，便拿出5000美元，托人转交给约里奥·居里先生，委托不久即将由法国归国的杨承宗代购仪器与图书。
杨承宗拿到钱已经是一年后了。钱三强在信中要他买几个同位素，研究原子能有关的书籍、仪器和药品，还有一种计数进位器。当时，朝鲜战争已经打起来了，中国是联合国军的敌人，要买这些比较先进的仪器，必须得到法国原子能委员会主任的特批，运出来要得到联合国军总部的批准，非常困难。
