1936年5月1日至5日，在西征中，红二十八军于1936年夏天围困陕北安边之敌月余，久攻不克。王耀南接到彭德怀命令，率部从甘泉前线赶赴安边。王耀南组织兵力挖坑道，掏好药室，爆破成功，此役王耀南也负伤。
1941年2月，彭德怀批准王耀南大规模使用地雷和构筑大量永备工事的方案，及组织工厂研制土地雷、滚雷等土装备并大量生产。彭德怀指示他在根据地周边推广“地雷战”，牵制日军对根据地的进攻。
1940年百团大战前，彭德怀决心破击正太铁路，王耀南协助刘伯承完善了正太铁路破击的战前工程准备，彭德怀同意王耀南坐镇总部现场指挥，对王耀南提出的至少出动18个团的请示，确定为至少出动22个团；1951年，在彭德怀批准下，王耀南率学习团随同董其武将军的第二十三兵团赴朝作战，他建议修筑坑道后，我二十三兵团伤亡由每军每日150人降为十余人；1952年5月，彭德怀命令王耀南率二百余名工兵、炮兵、航空兵干部组成的学习团赴朝鲜解决防空问题。当时我方每军（军团）每日阵亡人数在一百人左右。他提出打坑道解决部队的防空问题。部队全面开展坑道掘进作业后，伤亡减少30％。
9月，王耀南奉彭德怀之命再率学习团赴朝检查部队推广“坑道战”经验，找出不足和问题，提出解决的办法，后我军每日每个军阵亡人数已由80人降为2至3人；
彭德怀命令把“坑道战”及坑道掘进作为志愿军的日常工作和长期工作，志愿军部队全面贯彻执行。
毛主席称他为“工兵专家”“民族英雄”
林彪重用王耀南
1932年6月间，王耀南在彭杨步兵学校任工兵教员兼学员队排长时，恰逢一军团参加水口、南雄战斗。主动请命率新老学员七十余人攻上梅关要隘，这次攻坚战使大部分学员阵亡，他本人也负重伤。当时红一军团军团长林彪，参谋长陈奇涵批评伤亡太大；1933年2月，王耀南到一军团考核新学员，后参加一军团的军事行动。在战斗中当担任警戒的王耀南发现敌机俯冲准备投弹时，他将军团长林彪推下山坡，保护了林彪的安全；1936年红军东征，王耀南奉军团长林彪的命令，摧毁同蒲铁路。除敌人据守的几个大火车站外，他们捣毁了其余火车站的建筑和设施，使同蒲路彻底瘫痪。
1937年9月，平型关战役前，在友军杨爱源、孙楚将军配合下，王耀南完成勘察任务后，陪同师长林彪与杨爱源、孙楚会谈。在复勘中，林彪看了王耀南选的关沟段地形后说：“王耀南做的笼子（湖北话：圈套）不大度，但复勘直至灵丘只此地最佳。”
