如病人无全身性血管病变基础，加上支持疗法和静脉高营养，体质较好者，大多数不会形成持久而顽固的放射性小肠炎，可望逐渐恢复，2/3的轻型放射性肠炎病人亦可在4～18个月内好转或痊愈。
有人认为，广泛的盆腔手术如再予以放射治疗，则病变组织血液供应更加不良，其预后常较差，据估计放射性肠炎的死亡率为15%～37%。
一般认为，放射性小肠炎的预后较放射性结肠、直肠炎为差。关于放射性肠炎是否存在癌变的问题，一般认为小肠炎不会癌变，至于放疗后患者发生的直、结肠癌是否与放疗直接有关说法不一。有人对盆腔区放疗的妇女经 10年随访分析，发现其直、结肠癌的危险性增高1.2～8倍，因此主张对放疗10年后的病人应每1～2年做一次纤维肠镜检查，以早期发现直、结肠癌。
(1)由于个体差异性不同，大部分人对照射的耐受性是无法预料的，尤其是炎症或术后的粘连使肠袢固定、子宫切除或原先已有血管病变者(如动脉硬化、糖尿病和高血压等)，所以，应彻底切除原发的恶性病变，避免放射性治疗。如必须放射治疗者，放射治疗前应做好周密的计划，精确计算放射剂量，正确进行技术操作和在患者体内预置监护装置等，均至关重要。且在放疗过程中注意密切随访。
(2)有人认为，放疗前应用灭滴灵对正常直肠粘膜有防护作用，同时能减少对照射有耐受性的肿瘤细胞，因此可降低照射量。
(3)也有人认为，阿糖胞嘧啶能保护肠上皮细胞的抗放疗作用，因而能提高正常细胞的存活率。
