发酵工程是指采用现代工程技术手段，利用微生物的某些特定功能，为人类生产有用的产品，或直接把微生物应用于工业生产过程的一种新技术。
发酵工程的内容包括菌种的选育、培养基的配制、灭菌、扩大培养和接种、发酵过程和产品的分离提纯等方面。
到了１７世纪，西方近代资本主义制度的建立，生产力得到了前所未有的发展，人们的知识水平得到了大幅度的提高给发酵业的发展带来了契机。自１６７６年荷兰人列文．虎克用自制的显微镜发现微生物开始，各国科技工作者纷纷对“自然发生说”提出质疑，并将发酵产物与微生物联系在一起.到了19世纪的早期法国的巴斯德通过近二十年潜心研究，以自己科学结论说服了“自然发生说”，提出了“一切发酵过程都是微生物作用的结果，是生命过程”的理论，使发酵业在深度和广度不断得到发展，并与工程学结合形成新兴的工程——微生物发酵工程。
发酵是在人工设定的环境下使目的微生物大量繁殖。其过程包括以下三步：
一、上游处理过程
二、发酵、转化
三、下游处理过程
其具体操作过程如图1。菌种选育接种培养基
我国先民以大米、小麦
等酿出的酒甘醇可口，这些培养
农产品是发酵的材料微生物
的培养基。研究表明微生物分离
培养基包括碳源（构成细胞培养液细胞
物质或代谢产物碳架来源的
营养物质），氮源（氮素来源 死细胞生物量
的营养物质），无机盐，水和
生长因子。研究的成果使培
养基取材不断扩大，酒精发细胞破碎活细胞生物量
酵是一“古老”的技术，先
民利用谷物酿造酒其实质是
发酵生产酒精。进入工业化离心
时代后， 人们用森林工业和
