名称
圣弗朗西斯科(San Francisco)是曾被西班牙统治的地区的常见地名，得名自方济会创始人圣弗朗西斯（意大利文“San Francesco di Assisi”，英文“Saint Francis of Assisi”）。
汉译名称
19世纪这里是美国淘金热的中心地区，早期华人劳工移居美国后多居住于此，称之为“金山”，但直到在澳大利亚的墨尔本发现金矿后，为了与被称作“新金山”的墨尔本做出区别，而改称圣弗朗西斯科为“旧金山”。
至于三藩市之名，则是取自该市英文名称的头两个音节“San Fran”之谐音直译，是居住于此地为数不少的粤语族群较常用之译名，例如出身广东的中华民国国父孙中山在著作与书信中提及该市时，使用此名。
日语则多以片假名注音，但亦可写为汉字“桑港”。
译名问题
长期以来关于圣弗朗西斯科这城市的中文译名，在没有明确的官方政策下，用法稍嫌纷乱。美国之音和美国国务院都使用“旧金山”。目前，大部分驻于该市、拥有华文正式称呼的外事单位，都是使用“旧金山”之称呼，例如中华人民共和国驻旧金山总领事馆，或中华民国外交部驻旧金山台北经济文化办事处。在中华人民共和国的官方文献及地图中，则多称其为“圣弗朗西斯科”，但旧金山市政府（SFGov）及下属各级市政单位的官方网站中文版上，却是分别使用了“旧金山”与“三藩市”这两种不同的译名，没有一致的标准，而这现象也普遍反应在居住于该市的华人社群之使用习惯上。
