南方墨点法（英语：Southern blot），是由英国生物学家Sir Edwin Southern发明，并因此得名（Southern为南方之意），是一种普及的分子生物学实验技术。目的是侦测经由胶体电泳分离的样品中，含有特定序列的去氧核糖核酸片段。
通常，先利用胶体电泳分离脱氧核糖核酸（DNA）样本中各种不同大小的分子。不同大小的分子在胶体电泳之后，会分离而散布在胶体上不同的位置。接着，这些DNA分子可以利用虹吸作用，转染到一个薄膜上，经由DNA变性使它们的双股分开。因为双股DNA已经固定在薄膜上，所以变性后无法再形成双股螺旋；然后将上述薄膜暴露在杂交探针（probe）里，让探针和DNA杂交（hybridize）。探针是被会产生放射线、或可以放出颜色或萤光的物质标记的单股DNA或核糖核酸（RNA）片段；最后是观察结果。薄膜上可以侦测到放射性或者萤光讯号的位置，就是含有可以与探针核酸序列进行偶合的去氧核糖核酸样本散布的位置。
类似的技术也被用来侦测经由胶体电泳分离的样品中，含有特定序列的RNA片段，当应用在RNA的侦测时，被称为北方墨点法。
