抗日战争初期 创建民国26年(1937年)以国民革命军第159师国民革命军第160师编成国民革命军第66军隶属第12集团军，叶肇任军长，国民革命军第159师长原为谭邃，1938年10月陈骥继任师长国民革命军第160师原由叶肇兼任师长，1938年2月华振中继任师长。
1938年4月谭邃接任军长，10月谭邃病故，陈骥继任军长，下辖三个师:国民革命军第151师莫希德任师长，1939年1月林伟俦继任师长，国民革命军第159师陈骥任师长，1938年10月陈骥升任军长，官禕继任师长，国民革命军第160师华振中任师长，1939年1月宋士台继任师长，1940年国民革命军第66军被撤销。
抗日战争中期 第一次重建1942年3月，又以第二补训处改编成国民革命军第66军，张轸任军长，下辖国民革命军新编第28师、国民革命军新编第29师、国民革命军新编第38师，国民革命军第66军编成後即编入中国远征军入缅作战，国民革命军第66军驻防在腊戍、瓦城一带，1942年3月23日日军开始进攻，以纵队快速向细胞、腊戍穿插突进，第66军分段截击日军，1942年3月29日日军攻占腊戍，国民革命军新编第38师撤向印度、国民革命军新编第28师退回国内，第66军番号撤销。
国民革命军新编第28师为1939年5月由军委会别动队改编成，刘伯龙任师长，隶属重庆卫戍司令部，1940年开赴贵州，隶属滇黔绥靖公署，1942年11月李士奇继任师长，1943年改隶属国民革命军第71军。
国民革命军新编第29师为1939年5月以第二补训处之一部改编成，马维骥任师长，隶属重庆卫戍司令部，1943年改隶属国民革命军第6军。
国民革命军新编第38师为1938年12月以财政部税警总团改编成，孙立人任师长，驻防贵州都匀，在第一次滇缅战役後转至印度，後改隶属国民革命军新编第一军。
抗日战争中期 第二次重建1940年10月以国民革命军暂编第32师、国民革命军暂编第33师、国民革命军暂编第34师合编成国民革命军暂编第9军，以冯圣法为军长，该军编成後，在浙江又将国民革命军暂编第35师编入该军，隶属第三战区，1942年8月改隶属第六战区，12月改隶属江防司令部，1943年2月冯圣法他调，任命方靖为军长，1943年2月第六十六军撤销。
国民革命军暂编第32师，为1940年9月以浙江省国民自卫团第一纵队及浙江保安第六团为基干编成．以黄权为师长。
国民革命军暂编第33师，该师原为浙江抗日自卫部队，1940年4月以其第一、第六、第八支队和第五区总队并编为抗日自卫第二纵队，10月改编为国民革命军暂编第33师，以萧冀勉为师长，1943年9月周淘漉任师长，该师改隶属国民革命军第八十八军。
国民革命军暂编第34师，1938年1月成立第三战区游击司令部，该部以浙江省警员及各地常备队、壮丁编成4个支队，7月改编为浙江省国民自卫团总司令部，1940年将所属支队并编为3个纵队，3月将第三纵队改编为暂编第三十四师，彭巩英为师长，[[1942年]3月朱奇任师长，1943年2月以国民革命军第十八师副师长吴啸亚任师长，同时改隶属国民革命军第十八军。
国民革命军暂编第35师，以浙江地方部队编成，劳冠英任师长，1942年底，该[[师调至第六战区後，劳冠英被调任夔巫师管区司令，该师被并编。
1942年12月将暂编第九军改编为第六十六军。
抗日战争末期 第二次重建1943年10月再次以国民革命军暂编第九军改编为第六十六军，仍以方靖为军长，改辖第一八五师、第一九九师，1944年8月方靖调任第七十九军长，副军长宋瑞珂升任军长，第一八五师，师长方天，隶属第九十四军，1940年12月方天升任第十八军长，石祖黄接任师长，1943年李仲辛接任师长，第一九九师，师长罗树甲，1940年5月罗升任副军长，宋瑞珂接任师长，1943年2月、3月蘇令德、周天健相继任该师师长，1944年9月彭战存接任师长。
整编第六十六师,1946年5月由第六十六军整编而成,由原军长宋瑞珂任师长。1947年7月该师在鲁西南被歼,宋瑞珂被俘。
解放战争初期 第三次重建1947年9月重建该师,以李仲辛为师长。11月罗贤达接李仲辛任师长。该师辖:整编第十三旅,旅长罗贤达，罗升任师长後,由张洁接任旅长，整编第一八五旅,旅长李仲辛，1946年涂焕陶接李任旅长，1947年9月袁樾人接任旅长职；整编第一九九旅,旅长彭战存，1946年由王士翘任旅长,1947年9月张洁接任旅长,11月由萧炳寅接任旅长职。
整编第六十六师长李仲辛。辖整编第十三旅，旅长罗贤达，1948年3月郑洁接任旅长,整编第—八五旅,旅长周穆深；整编第一九九旅。旅长张洁，1948年10月萧炳寅接任旅长，该旅於1948年6月改隶属第七十九军,该师及所辖第十三旅，6月在河南开封被歼，师长李仲辛自杀。
解放战争末期 第四次重建1948年7月又重建该师，以罗贤达为师长，辖第十三旅,旅长罗有经；第一八五旅，旅长袁樾人。1948年9月恢复第六十六军番号,罗贤达改任军长，各旅长改为师长。
1949年初改隶第七绥靖区，是年4月该军在皖南又一次被歼。
