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1915年2月，袁世凯为了达到称帝的目的，向日本政府求助，日本政府便借机提出“二十一条”作为交换条件。孙中山在国内的一片声讨之中发现李大钊的文章和自己很有共鸣。
梅屋庄吉请孙中山到自己家中，交给他黄兴托人从美国转来的蔡锷将军提供的有关“二十一条”内幕和推翻袁世凯打算的密码电报。宋庆龄为孙中山翻译电报，胡汉民看着两人忽然觉得他们关系不一般。
孙中山收到哥哥孙眉去世的电报，深为不能回国奔丧而感到痛心，胡汉民、陈其美和廖钟恺等人商议如何阻止宋庆龄和孙中山的感情发展。胡汉民来找宋庆龄谈，碰壁而回。宋嘉树收到廖仲恺的信，立刻发信称自己病重，让庆龄回上海。宋庆龄留信出走。孙中山急忙去追，在火车站孙中山追到宋庆龄，心灵的撞击使两人拥抱在一起。
1915年5月9日，袁世凯签署了丧权辱国的“二十一条”，全国掀起了反日倒袁的群众抗议浪潮。
胡汉民和朱执信来说劝孙中山，请他不要和宋庆龄发展感情。这反而使孙中山在内心更加确定了对宋庆龄的感情。
《孙中山》分集介绍 第十三集：
冯国璋受北洋军阀将领所托，来试探袁世凯是否要称帝。袁世凯狡猾地骗过冯国璋。
孙中山征求陈炯明对他和庆龄的看法，陈炯明支持孙中山和庆龄。宋庆龄接到父亲病重的电报准备回国。她和孙中山依依惜别，并约定最多三个月就回来。宋嘉树倪桂珍和以怀孕的宋霭龄到码头迎接宋庆龄。
宋庆龄走后孙中山心神恍惚，茶饭不思。梅屋夫人看着心疼，来找陈其美等人商量。陈其美、何香凝、廖仲恺和陈炯明等人商议后，决定帮孙中山完成婚姻大事。
宋嘉树想劝说宋庆龄离开孙中山，宋庆龄明确的向家人表明心迹。卢慕贞来到日本，并主动提出离婚。
袁世凯加紧称帝前的准备。反对帝制的严修等人在袁克定的威逼下，也同意帝制。
宋嘉树为了让宋庆龄死心，把她软禁在家中。陈惠奉命来找庆龄，她用计骗过宋嘉树见到宋庆龄。晚上，陈惠带人撬开铁窗，帮助宋庆龄逃出家，庆龄洒泪而别。
宋嘉树冒雨追到码头，船以远去。
《孙中山》分集介绍 第十四集：
1915年10月25日，孙中山和宋庆龄正式结婚，宋嘉树痛苦的发誓与二人绝交，不再认女儿和孙中山。
袁世凯复辟在即，孙中山和大家开会商议，立刻在全国组织起义。在经费问题上，陈炯明和胡汉民发生争执。
蔡锷在小风仙的掩护下，逃出北京。袁世凯虽然镇压了陈其美在上海的起义，但各国公使忽然反对他称帝，蔡锷又成功叛逃，使他头痛不已。
1915年12月，孙中山得知袁世凯称帝，决定携宋庆龄秘密潜回上海策动起义。
1915年12月25日，蔡锷在云南誓师起义，护国讨袁。
1916年2月，宋嘉树在卧病之中，仍关心孙中山的革命。
1916年4月27日，袁世凯在全国声讨之中宣布取消帝制。黄兴也回到上海，孙中山和久别重逢的黄兴拥抱在一起。宋庆龄回家看望父亲，宋嘉树负气不认。
病入膏肓的袁世凯指派袁克定暗杀孙中山等人。陈其美赴约时被杀，孙中山因临时有事没去，幸免遇难。孙中山得知消息，不顾个人安危，前往吊唁。1916 年6月6日，袁世凯等不到暗杀孙中山成功，病中死去。孙中山、宋庆龄等人得知非常高兴。蒋介石带来了黄兴安排的警卫连，孙中山惊喜地发现区小妹、区兰和马湘又回到他的身边。
《孙中山》分集介绍 第十五集：
1916年10月，孙科已学成毕业，孙中山命他回国效力。朱执信带来黄兴病重的消息。孙中山前往探病，病榻前黄兴拉着孙中山的手，带着对革命的憧憬与世长辞。
1917年4月，段其瑞借一次世界大战出兵欧洲之机和黎元洪争权，张勋趁机挑动各省军阀自制。
7月，张勋和康有为等人扶植12岁的溥仪复辟。
孙中山准备南下广州组织扩法运动。临行前和庆龄去看望病重的宋嘉树，宋嘉树终于原谅了两个人。
1917年7月25日，孙中山在广州成立军政府开始护法战争。由于桂系军阀把持财源，军政府的财政十分困难。孙中山意识到要想革命胜利，必须组建自己的军队。孙中山准备让陈炯明改编广州警卫军，二十个营，八千人建成护法军。
广州督军莫荣新杀害无辜，孙中山下令炮轰他的驻军。莫荣新一面假意请罪，一面买通刺客暗杀孙中山，暗杀行动被粉碎，但区兰在战斗中牺牲。
1918年5月20日桂系军阀勾结北洋军阀，改组军政府，孙中山愤然辞职，再度返回上海。
孙中山临行前嘱托陈炯明看好自己的革命队伍。
返回上海途中，庆龄受到电报，宋嘉树因病去世。
《孙中山》分集介绍 第十六集：
1919年5月4日“五四”运动爆发，孙中山接受很多革命的新思想，他在经费紧张的情况下，出钱资助青年学生。1919年6月15日孙中山会见青年学生代表。
孙中山让孙科跟随朱执信去广东参加讨伐桂系的战斗。并将已经鱼龙混杂的中华革命党改组为中国国民党。
1920年9月21日朱执信在虎门调停两只起义部队冲突时，中弹牺牲。10月反桂系军阀斗争胜利，翌年4月7日孙中山在广州当选为中华民国大总统。
1921年7月1日中国共产党成立。8月10日，孙中山开始了为早日统一中国的北伐大业。在北伐不断取得胜利时，陈炯明却接种种理由阻挠北伐。孙中山告戒陈炯明，以大局为重，支持北伐，陈炯明满口答应。
1921年12月23日孙中山会见共产国家的代表马林。马林建议孙中山搞国共合作。
陈炯明公开阻找北伐，孙中山被迫改变北伐路线，亲回广州劝说陈炯明，在陈炯明的公馆里，陈炯明部下商定十六日炮轰总统府，廖仲恺在去会见陈炯明时，被陈的部下抓捕。
众人劝说孙中山尽快离开总统府，以防陈炯明叛变，孙中山不相信，打电话让陈炯明来总统府面前，陈慨然应允。只身来见孙中山，使孙中山再次相信了陈炯明。
《孙中山》分集介绍 第十七集：
深夜，总统府粤秀楼中，孙中山仍在工作。孙昌带来准确消息，陈炯明今夜将发动叛乱。众人劝孙中山离开，孙中山却想到身为大总统的他，应该留下来平息叛乱。
叛军开始攻打总统府，孙中山指挥众人收拾文件，庆龄命林直勉和孙昌护送孙中山先走。孙中山等人化装逃走。叛军和卫队激烈交火，宋庆龄还在处理文件，区小妹、马湘掩护庆龄撤退，途中，区小妹为了掩护宋庆龄中弹牺牲。
孙中山等人在永丰舰上，焦急的等着宋庆龄。宋庆龄在马湘护送下终于回到永丰舰，但已有身孕的她在突围时流产了。
