游击队对敌人的水上交通线也进行了袭击。白俄罗斯第聂伯河－布格河运河因六道闸门遭到破坏而航运中断。1943年，乌克兰游击队和地下工作者在第聂伯河、杰斯纳河和普里皮亚特河共击沉和击毁90艘轮船、驳船、快艇和摩托艇。
由于游击队对交通线的袭击增强，德军大本营1943年8月份要求中央集团军群“将未直接参加前线作战的全部兵力，包括教导团、预备队兵团和航空兵非飞行人员均用来保卫铁路。
1944年1月14日至25日，列宁格勒游击队共炸毁铁路桥梁34座，破坏铁轨22000多根，毁坏路基30公里，摧毁车站和会让站11个。在袭击这些目标时，还消灭了德军警卫部队大量官兵。在列宁格勒和诺夫哥罗德战役期间，游击队共消灭了德军21500余人，炸毁铁轨58500余根，炸毁桥梁300余座，颠覆德军用列车136次，破坏电话电报通信线路500余公里，烧毁汽车1620辆和仓库28个。
乌克兰游击队仅在1944年1月份内就颠覆德军用列车45次，2月份为156次，3月份达179次。由于游击队的破坏，上半年德军用列车共翻车863次，其中不少是发生在一些重要的交通线上。
白俄罗斯游击队在1944年1月份炸毁敌军用列车670多次。他们经袭击铁路，1至5月份，游击队在各铁路破坏德军的军用列车，在明斯克－布列斯特区段共达757次，明斯克－博鲁伊斯克区段391次，巴拉诺维济－利达区段236次，布列斯特－科韦耳区段116次。
据不完全统计，游击队在44年上斗年共炸毁、颠覆德军用列车4800多次。白俄罗斯的铁路通过能力仅为原来的12%至40%,苏军在白俄罗斯战役前夕，游击队于1944年6月19日一夜破坏铁路4000多处，制造爆炸事件15000多起，在关键时刻德军后方瘫痪，补给线中断24小时，为苏军成功地实施白俄罗斯战役作出了突出贡献。
对交通线的袭击不仅局限于铁路，游击队在公路上对敌人辎重、行军纵队以及单个汽车和马车进行了有效的袭击。在1944年冬、春两季，仅白俄罗斯游击队平均每月就炸毁100多座桥梁，近1000辆汽车。德军几千公里的电话电报通信线路被破坏。
从1941年6月到1944年7月，白俄罗斯被占领土上的游击队员和地下抵抗力量的战士总共击毙或俘虏了50万纳粹分子。在驶往东线的11128列德国列车中，有34列装甲列车被白俄罗斯游击队炸毁或弄出轨。29座火车站、948个军事指挥所、18700辆轿车和卡车、819条铁路和4710座公路桥被白俄罗斯游击队破坏了。白俄罗斯游击队员和地下抵抗力量成员在二战期间获得了14万枚战斗勋章和奖章。其中88人以他们的英雄事迹获得了”苏联英雄“称号。
