B-29B
B-29B 是轻量化的版本，由贝尔-亚特兰大公司生产。B-29B 取出了所有的自卫炮塔，只保留了尾炮，但也改成由
AN/APG-15B
雷达火控系统自动控制，之所以这样做是因为李梅需要更快更轻的轰炸机来轰炸日本，并且在实战中发现日本战斗机倾向于从轰炸机尾部进入攻击。B-29B 生产了 311
架，速度有所提高。
B-29C
被取消的计划，愿准备将 B-29 改装 R-3350 发动机，未建造。
B-29D
B-29D 计划使用 4 具 3,500 马力的 R-4360-35 发动机，以其大幅提高 B-29 的性能。相应的
B-29D 的机翼结构加强，垂尾加高，与原先的 B-29 在结构上大相径庭，所以在战后改名为 B-50。B-50
是少数从二战开始研制并在战后幸存下来的项目，1946 年，第一架 B-29D/B-50 被建造出来，但是正式名称是 B-50A，B-50A
成为美国空军最后一种全螺旋桨轰炸机。
