第二章
黑衣の破坏者
ACT.1
战斗区域：位于热带雨林中的卡修族村
對話選擇
下
任せて
上
依頼を成功させよう
上
わかった
上
全然わからない
下
村が気になる
做完一次自由任务后回到据点发生剧情，克劳齐委托玩家到莫多普行星寻找一个兽人族的男人，玩家和女主角到达莫多普行星的文化保护区后遇见同样也在找人的兽人夫妇托尼奥和莉娜，四人认为这个区域虽然有很多飞船停留却没有其他人在觉得很可疑，于是便决定一起行动。一行人来到卡修族的村子作调查，发现到处都是卡修族设置的陷阱，通道被火柱陷阱挡住通路，此时玩家只需要按L+方向键呼出主观视点就可以向着紫色的花作调查，调查后就可以穿过火焰继续前进。来到第二层会有一个石墙挡住玩家去路，此时只需要呼出主视点调查就可以将石墙击破。一路上怪物以土属性和火属性为主，进入第三层后在柱子群中见到一棵树向树上调查后用枪将果实射下来，调查后可以获得提示拥有紫色花的通道是正确的，其他都是陷阱。进入提示的通道后就遇到卡修族的少年尤多，尤多误会了众人是来袭击村子的，于是便向玩家发动攻击，此时马上进入BOSS战。
★BOSS战
★卡修族少年
卡修族少年体积小而且攻击速度很快，还会专门攻击玩家，刚开始是土属性，受到一定伤害后变成火属性，推荐使用远程攻击武器。
提示:通道选择为1.调查紫花2.从火柱通过3..打破石岩4.二层调查紫花5.走没有黑火的通道6.分支路段上打破中间的石岩7.调查岩石下的机关8.选择向非机械箭形符号的一方9.有紫花一边的通道
ACT.2
卡修族村周边
對話選擇
下
エミリアを助け起こす
战斗后托尼奥和莉娜二人决定留下照顧少年，让玩家和女主角先走，于是二人便继续搜索行动。刚进入第一层守门口的是我们熟悉的PSO经典怪物钻头拉比鸟，与PSO时代的攻击方式不同的是它钻到地下向玩家追尾，还会腾空冲向玩家，此攻击方式带有击倒效果，被打到也会很伤，要注意多用回避和格档。进入第二层后来到大广间会有个粉红色的伪钥匙，此时玩家只需要装备近身武器将它击破即可。来到最后一区守关的是一只电兽，主要攻击方式为全身发出电向玩家作带有小小追尾性的冲击，因为是连续性攻击，所以建议没装备盾且HP防御力教弱的玩家不要防御，在怪物就快要冲过来的时候用回避动作躲开攻击。击倒守门兽后，玩家与女主角来到卡修族村内，此时的卡修族村正被大火吞噬，二人发现一个看起来并非卡修一族的白发黑衣少年，少年手上正拿着一个红色的记录卡，少年将艾米莉亚称呼为“消失了的存在”，并且带有强烈的杀意，正当少年向女主角发动攻击时，美加及时出现救了她。随后托尼奥和莉娜便赶到，发现跟随在少年身边的兽人众好象是被洗脑的样子，托尼奥和莉娜要还要继续调查，就把卡修族的少年和昏迷的女主角带回Little Wing的任务交给玩家。
回到据点后，克劳齐叫玩家到咖啡店商量，寒暄一阵后女主角就来叫玩家到移动室中，告诉玩家在与白发黑衣少年战斗时总觉得那并不是自己的意志，女主角终于察觉到美加的存在，美加向女主角表明身份后，告诉女主角和自己是记忆共有的，女主角才记起玩家是为了救自己曾经死了的事实，因此而自责起来，为了不再连累玩家，女主角便向玩家请教战斗的方法，于是便决定马上跟玩家去Free Mission作训练，到此第二章结束。
劇情对话结束后，系统开放行星莫多普的移动许可，并开放自由任务「修罗の谷」、「热带雨林の猪突兽」、「最凶の砂兽」和道具交换任务「砂漠惑星のオアシス」以及咖啡店的NPC委托任务。
完成了一個自由任务返回据点后，女主角叫出美加，商量为了阻止旧文明的人类抹杀计划必须先阻止亚空间研究，因为亚空间移动会去到旧文明人所存在的「マガハラ」，但经过一番商量后都想不出方法，此时众人便决定先找克劳齐商量。
