第三章
造られた「希望」
ACT.1
战斗区域：生物研究设施
對話選擇
上
そんなことはない
上
その通りだ
上
わかった
玩家与女主角来到Little Wing中，发现之前在卡修族一同进行调查的托尼奥和莉娜也在，原来二人在卡修族执行任务时遇见克劳齐，二人因为以前曾当过海盗所以没有其他组织允许加入，而Little Wing的条件只有一个就是“实力”，于是二人便决定加入Little Wing。接收完托尼奥和莉娜的队友卡片后，玩家和女主角便来到克劳齐的工作座位处，将事情的来龙去脉向克劳齐告知，但是克劳齐并不相信，要求二人连同托尼奥和莉娜去一起执行任务，于是二人便去到美容店找托尼奥。
本次任务是要来到帕尔姆行星中帮助インヘルト社研究中心将实验中逃跑的新种原生生物アスクーク驱逐，众人来到研究所中，艾米莉亚还在因为克劳齐不相信的事而烦恼，托尼奥为了鼓励她，说出自己曾经作为G组织的教官保证她，艾米莉亚听到G组织这个词后忽然想起了某些被遗忘的记忆。莉娜将任务向玩家和女主角说明后便开始驱逐，本区域的怪物以电和火属性为主，沿途会碰到新怪物ヮルムス，这种怪物在被击破消失前会防出攻击球作最后反击，玩家要注意击破这种怪物时不要对着它。这次任务中的所有门锁开关都有限时，要注意先清理途中出现的怪物，否则会不够时间赶过去。第二层的其中一个限时开关需要点技巧才能到达目的地，如图示先去打开开关，然后到外面清理好所有怪物后，再次打开开关，赶去传送点就可以到达被锁的门口。
镇压完原生生物アスクーク后，设施警报突然响起，インヘルト的职员跑来向众人求助，原来是设施内的机器暴走，众人便决定将主领导机器レオルヴァリア的制御装置破坏。（艾米莉亚流露出与平时不同的见解，建议众人先将主领导机器的制御装置破坏，在卡修族时也是，马上就能辨识到卡修族的语言）由于亚空间发生装置的就在这个研究设施的地下，所以研究人员都不希望放弃这个设施。
ACT.2
战斗区域：亚空间研究设施
對話選擇
上
クラウチに怒られる
上
よくがんばったと思う
本区域的怪物基本以电和火为主，一路上都是些小杂兵，到第三层时会有几台大型机器，这种大型机器有两种主要攻击方式，一种是对着玩家连续扫射，另一种就是向玩家进行冲撞攻击，这两种攻击前一种可以善用完美防御，完美防御后它就不会继续扫射，冲撞只需要回避动作就可以躲掉。
★BOSS战
★レオルヴァリア
BOSS的几种攻击模式
第一种完全不会中的是光线炮，这时候他的脚会小幅度动作，不过不怎么影响攻击。
第二种跳起重压，这个可以回避躲过。
第三种浮空脚上会放出蓝色光圈追尾，这个时候只要跑上平台就不会受到伤害了。
第四种旋转追尾兵器，此攻击分别会有两次袭向玩家，玩家只需要格挡掉即可。
第五种地上随机喷出蓝色烟雾，这个攻击因为有NPC在一般不会向玩家攻击。
第六种对着玩家连续喷发蓝色炮弹，这个攻击如果第一下没能挡掉，那么就很容易被连击至死，所以如果吃了第一下攻击必须快速吃药补血。
第七种浮空移动在身体四周落石，此攻击移动速度慢，跑路或者在它底下都不会受伤害。
战斗后众人遇见了インヘルト社的代表夏目（ナツメシユウ），从夏目代表口中得知原来亚空间研究设施和レリクス一样同为集合了旧文明遗产的地方，要移民到目的地亚空间实际上就是发现了旧文明的地方，而亚空间研究实际上就是旧文明技术的研究。 众人跟夏目代表道别后回到据点，切尔茜向玩家和女主角传话，克劳齐要见二人，来到Little Wing找克劳齐，他对女主角大加赞赏，女主角对此感到非常高兴，到此第三章结束。
对话完毕后，系统开放行星帕尔姆的移动许可，并开放自由任务「エンドラムの残党」、「多脚兵器破坏指令」、「砂尘の机械兵士」、「狂う珍兽」和交换任务「机械惑星の秘密结社」以及美容店开放祈祷师小夜的柜台。
完成一次自由任务后，切尔茜便跟女主角联系，告知卡修一族的少年已苏醒，于是玩家与女主角一起到Little Wing了解那位少年的情况，见面后少年马上提高警戒，在女主角的关心下，少年解除了警戒，对话后得知少年名叫尤多，女主角觉得尤多昏迷了一段时间便提议自己请客带尤多去咖啡店吃东西，尤多在进食时已和女主角熟落起来，女主角因为之前被克劳齐表扬，决定买礼物送给大家，正当众人聊得兴起时，Little Wing内部发生紧急事态，原来CLAD 6被不明武装集团入侵，切尔茜决定将CLAD 6内的所有设施暂时关闭减少损害，但当女主角听到枪声时，便冲出咖啡店，刚好碰上持枪的入侵者，原来他们的目的是要袭击女主角，乌鲁苏拉突然出现救了女主角，随后克劳齐在外喝完酒也回来了，乌鲁苏拉苛责克劳齐没有管好治安，此时女主角发现自己买的礼物不见了，其中要送给克劳齐的礼物被本人拾到了，被喝醉酒的克劳齐出言不逊给伤害了，女主角伤心地跑走。将寻找女主角的任务交给尤多后，玩家便按指示来到Little Wing找乌鲁苏拉，对话中了解到原来乌鲁苏拉才是Little Wing的统筹者并且是CLAD 6的舰长，而自称是统筹者的克劳齐则是充当Little Wing的监督角色，因为担心Little Wing的管理问题，乌鲁苏拉决定留下来。来到Little Wing门前发现尤多已经找回女主角，与尤多交换队友卡片后，到控制室找女主角，此时她正在发泄怒气，当女主角稍微冷静点时，美加向二人说当时在袭击者眼中看出异样的视线，尤多也表示那种视线给人不好的感觉，原来尤多也能看见美加，尤多觉得美加跟他们族人侍奉的大地神十分相似，交谈中得知卡修族一直按照旧文明人留下的记忆体侍奉着大地神，那个记忆体就是之前白发黑衣的少年抢走的东西，为了夺回记忆体，尤多要求众人一起修行。
再完成一次莫多普行星的自由任务后，克劳齐告诉大家有新的委托工作，众人来到Little Wing，这次任务是インヘルト社直接委任，成为亚空间发生研究的警卫，具体内容就是要在将装置周边的原生生物消灭，因为责任重大所以インヘルト社同时也会聘请同盟军和G组织的成员，而Little Wing将会派遣玩家、女主角和尤多一起负责。
