苏联军队入侵阿富汗时，美国的卡特政府正陷于伊朗人质危机不得脱身，根本无暇顾及阿富汗问题。1981年１月对苏持强硬态度的里根入主白宫，他任命情报界的元老威廉·凯西出任中情局局长。凯西上任后不久，就会见了负责秘密行动的副局长麦克马洪，听取了有关阿富汗局势的汇报。当时美国政府已批准向抵抗运动提供武器。在苏联入侵阿富汗之前，美国就向抵抗运动提供了医药、通信装备和如何获得武器的技术性建议。听取完汇报后，凯西说：“我们应该做得更多，我想在地球上找到一个地方，一个我们可将苏联人‘将死’并击退他们的地方。否则他们永远不会回到谈判桌前。”
这个将苏联人“将死”并击退的地方，美国人选在阿富汗。美国决定：秘密支援与苏联对抗的游击队。在苏军入侵阿富汗之后的１８个月里，中情局建立了一个向阿富汗游击队秘密运送武器的庞大运输网。
美国和沙特阿拉伯提供资金，埃及负责训练，巴基斯坦负责运送，中情局负责运输网的协调。美国提供了卡拉什尼科夫步枪、反坦克地雷以及从美国和埃及库存中调拨的武器。苏式武器则在中情局控制的埃及和美国的工厂制造。
1982年12月，里根总统指示中情局再次提高向抵抗组织提供武器的质量和数量。除了武器之外，美国还大幅增加了向抵抗运动提供的经费。到1985年财政年，用于阿富汗秘密战争的开支已达到每年2.5亿美元。
1985年３月，里根总统签署了国家安全指令166号文件，该指令要求增加向圣战者提供的军事援助，并明确指出这一努力的目标是将苏联人逐出阿富汗。按照这一新政策的要求，中情局向游击队提供了用于ｃ-４炸药的延时定时器、远程狙击枪、反坦克导弹。此外，中情局甚至大慷其慨，向游击队提供了美国人千辛万苦搞来的阿富汗战场苏军目标的卫星侦察数据、苏军的军事计划和通信情报。
为了将近３０亿美元的军火通过庞大的秘密运输网运送给抵抗组织，中情局花了大量心思，购买了几千头田纳西州的骡子，这些骡子千里迢迢远赴南亚，从巴基斯坦通过崎岖的山路向阿富汗运送武器。此外，中情局还玩开了政治手腕，向游击队提供了近２０亿的阿富汗假币，让他们贿赂政府官员，瓦解政府组织，动摇政府军心；同时用于向运送物资的人员支付报酬。1986年10月，侵阿战争正酣，占绝对优势的苏联空军对抵抗组织的打击日益严重。一天，驻贾拉拉巴德机场的苏军直升机部队像往日一样旁若无人起飞升空，准备对游击队的根据地进行突然袭击。不料刚刚起飞，对面山坡上就飞来３道火光，３架米-２４直升机当即被撕得粉碎坠落下来，苏联人大惊失色，不知道阿抵抗组织强烈的防空炮火来自何处。击落米-２４直升机的是美国人的杰作。“毒刺”是美国第二代便携式地空导弹，装备红外、紫外“双色”导引头，中情局行动部处理部长爱德华对此评论说：“一个没有受过教育的阿富汗抵抗运动成员也可以轻易地用‘毒刺’导弹击落价值数百万美元的苏军飞机。”但美国为是否向阿富汗援助“毒刺”导弹曾大起争执。美国国防部担心这种先进的防空武器落入敌手，反对向游击队提供“毒刺”地对空导弹。
