《钢弹Seed》剧情介绍第五话：フェイズシフトダウン
在强袭高达面前出现的是被夺走的四架高达。混战中，先行出击的穆出其不意地袭击了ZAFT军的威萨利乌斯号，但伊扎克和迪亚克无视撤退命令，继续攻击吉良。能量消耗严重的强袭高达解除了相转移装甲，危急中，圣盾高达变形为MA形态强行将强袭高达带走。在穆的援护下，强袭高达利用换装补充了能量，艰苦地将伊扎克等人击退。
《钢弹Seed》剧情介绍第六话：消えるガンダム
艰难地摆脱了ZAFT军的追击的大天使号逃入阿尔特弥斯要塞，然而在这里等待着他们的是友军士兵的枪口。虽然同在地球联合内，但玛琉等人所属的是大西洋联邦，而阿尔特弥斯要塞则是欧亚联邦的势力范围。想要获取高达的机密的阿尔特弥斯要塞司令加尔西亚软禁了大天使号上的成员。克鲁泽队的尼科尔利用自己驾驶的迅雷高达特有的“海市蜃楼系统”破坏了阿尔特弥斯要塞的全周围光波防御带发生系统，吉良趁隙驾驶强袭高达出来迎战。但决战高达及暴风高达此时已开始对要塞展开攻击。在大天使号逃离之后，曾经夸称“难攻不落”的阿尔特弥斯要塞开始崩坏。
《钢弹Seed》剧情介绍第七话：宇宙の傷跡
利用ZAFT军攻击阿尔特弥斯要塞的间隙，大天使号暂时逃离了克鲁泽队的攻击。然而舰内却出现了物资严重不足的新情况，为了解决这一问题，穆提出了利用位于碎石带上的废弃舰船上的物资的方案。
另一方面，返回PLANT述职的拉乌和阿斯兰，在国防委员长帕特利克·萨拉的指使下片面陈述了赫利奥波利斯事件。PLANT最高评议会内，强硬派势力开始抬头。
为从“尤尼乌斯7”的残骸中搬运物资的多尔等人担当哨戒任务的吉良遭遇了一架侦察型金。为了保护多尔等人，吉良将侦察型金击毁。在现场还发现了一艘救生舱，吉良将其带回到大天使号上。
《钢弹Seed》剧情介绍第八话：敵軍の歌姫
在救生舱里的人是PLANT最高评议会议长西格尔·克莱恩的女儿、阿斯兰的未婚妻拉克丝·克莱恩。天真烂漫的拉克丝即使在敌对方的大天使号上也没有丝毫的不安感，而对拉克丝抱有敌意的也仅有芙蕾一人。
作为拉克丝的未婚夫，在威萨利乌斯号的维修期间进行短暂休整的阿斯兰因拉克丝失踪一事被紧急随队派往碎石带进行搜索。而此时的大天使号，也与第八舰队的先遣队联系上了。
《钢弹Seed》剧情介绍第九话：消えていく光
盼望已久的救援即将到来的消息使大天使号舰内一片轻松。芙蕾的父亲，地球联合外务次官乔治·阿尔斯塔也随先遣队一同前来。但就在两方汇合之际，克鲁泽队对先遣队和大天使号发动了攻击。
芙蕾劫持了处于被软禁状态的拉克丝来到舰桥上，希望以拉克丝为质换得父亲的安全，但就在此时乔治·阿尔斯塔所乘坐的“蒙哥马利”号被击沉。在先遣队全灭、大天使号也岌岌可危的情况下，娜塔尔以拉克丝为人质，对克鲁泽队通讯，要求停火。
《钢弹Seed》剧情介绍第十话：分たれた道
因顾忌到拉克丝的人身安全，克鲁泽队停止了对大天使号的攻击。芙蕾将父亲的死归咎于吉良不肯全力作战。
