四发的 Me 323C 原型 1 号机
6 发的原型 2 号机的空机重量由 Me 321 的 15 吨增到 27.5 吨，包括最大载荷 12 吨货物时总重达 44 吨。Me 323 的两架原型机于 1942 年 3 月在拉普汉姆完成。虽然它们的起降和操纵性能良好，但载货后需曳航起飞的 4 发的 C 型最后被放弃，以集中精力发展 6 发的 D 型。Me 323 原型 3～12 号机（先行生产 D-0 型） 在 12 月完工后，奥贝尔特拉堡工厂开始制造生产型 D-1、D-2 型。
1942 年 7 月，拉普汉姆工厂制造的 D-0 型 1 号机完成，当年制造的 10 架全部交付德国空军，大部分仍留在拉普汉姆作研究开发用机。奥贝尔特拉堡工厂制造的第一架 D-1 型在同年 9 月完成，年内也制造了 16 架。Me 323 以后的生产分散到几个工厂：曼尼斯曼公司制造主翼大梁和机身中部的钢管骨架；杜塞尔多夫的拉特公司生产机头；斯柯达公司制造起落架；而木质部件仍由曼伊家具工厂制造。
