项目出现了转机。容克发动机制造厂及时的向梅赛斯密特公司提供了该型发动机。第三架原型机 Me 262V3（PC+UC，W.Nr.000 0003）成为第一架安装
Jumo 004 发动机和第二个飞上天的 Me 262。Jumo 004 的外形尺寸较 BMW 003
粗且长，所以不仅需要重新设计发动机吊舱，还需要扩大垂尾面积（通过增加其高度实现）以保持安定性和重心；同时稍微缩短了平尾的翼展，重新配平了升降舵，由于上述改变，Me
262V3 上出现了新问题——紊流场扩大。座舱盖部分的变化不大，弧形外凸的前风档没有附加平板防弹玻璃，沿用了 V1
的多框式活动中段，向右侧翻转打开。主翼外形没有变化，内段平直，外段后掠。安装工作于 1942 年 6 月 1 日结束。
Me 262V3 侧视图
由于奥格斯堡的跑道不完全符合 Me 262
的起降要求，后续的试飞转移到了多瑙河畔的莱普海姆（Leipheim）机场。虽然莱普海姆机场的跑道不是很长（全长 1,100
米），但它是钢筋混凝土结构的，而且拥有足够的备降区。
