年截击机过渡版的研发，使之能够早点服役，稍后再确定全面发展版的可行性。过渡版编号 F-102A，先进的全面发展版编号 F-102B。F-102A
将使用动力有限的 P&W J57 涡喷发动机，而 F-102B 将仍然使用高推力的 J67。F-102A 将装备过渡性质的火控系统，而 F-102B 将装备
MX-1179 项目下尖端的休斯火控系统。
尽管 F-102A 仅被当作 F-102B 之前的过渡版本，它仍然遇到了一些预想不到的困难，并且严重落后于预定计划。许多原先拨给 F-102B
的经费，现在只好拨给对 F-102A 的改进。F-102B 也因此进一步落后于预定计划，同时开始失去一些本属于它的优先权。
到 1953 年年中时，MX-1179 火控系统（后来被称作 MA-1）正遭遇严重麻烦。在实验设备能够安装到 T-29B
上接受测试前，又花费了额外的一年时间。与此同时，莱特 J67 引擎自己也出现问题，空军需要考虑替代动力，最终选定了 P&W J75，它是 F-102A 使用的
J57 的先进版。1955 年初，用 J75 替换 J67 的方案被通过。
1955 年 11 月，订购了 17 架 F-102B，编号从 56-451 到 467。1955 年 12 月，F-102B 准备好接受审查。1956 年
4 月 18 日，空军敲定了上年11月的 F-102B 生产合同，全部 17 架飞机都被用于测试。规定 1956 年 12 月交付一架原型机，其余在 1957
年 1 月交付。
1956 年 6 月 17 日，F-102B 的编号变更为 F-106A，因为官方认为到目前为止它已经是一种完全不同于 F-102A
的飞机了，而且要先进得多，同时还认为技术差别已经干扰了 F-102 项目。
1956 年 9 月，空军明确表示 1958 年 8 月前将得到
F-106A，这比初始计划完了四年。它不得不同半自动地面防空预警系统（SAGE）兼容，该系统的探测半径达到 430 英里（692 千米），探测高度达到
70,000 英尺（21,336 米）。截击机将能够在 35,000 英尺（10,668 米）上达到 M2，并能在休斯 MA-1
火控系统的引导下发射空空导弹和火箭。
F-106A 的机翼和 F-102A 的实质上是一样的。如同后者一样，F-106A 安装有外段机翼附面层隔板（翼刀），这种设计在 1957
财年被替换成了前缘缝翼设计。微小的战斗损伤，哪怕是机翼上的一个弹洞就可能使整个系统报废。基于这种考虑，“湿”翼内没有设置软式油箱，通过低压旁路从发动机引气充入油箱来实现燃料传输。
两者的主要外部差别在机身，F-106A